一、除草剂喷雾
芦苇是一种很难除根的植物，它的生命力比较顽强，具有发达的根系，在一些环境中都能生长。将庄稼收好后，等待秋季芦苇开始发黄即将枯萎的时候，可以用除草剂喷雾喷施，可以选择百草枯或者是草甘膦，按照一定浓度配制好溶液往芦苇上喷雾，也可以用硝磺草酮、烟嘧磺隆、莠去津混合，之后喷雾进行防治。注意对于鱼塘或者稻田的芦苇，为了防止对水塘造成污染，需使用选择性除草剂，例如高效氟吡甲禾灵为选择性除草剂。
二、草甘磷注射
这个方法效果很好，但是比较费时间，适合小面积的芦苇。将芦苇折断后割断后，用10%草甘膦1:1兑水来稀释，用针管吸取，然后把药液注射到芦苇芯里面，每杆注射5毫升左右。注射药后，第二天杆尖叶片就会发黄，到了第四五天左右，如果有几株没有发黄的，可以再次注射，差不多天左右就能彻底杀死枯萎。
三、人工去除
如果时间允许，并且面积较小的话，可以采用人工去除的方法，对于集中连片的地方可以人工挖除芦根。也可以等到每年秋后深翻土地，将芦苇根捡起晒干烧掉。